Présentation du microbiote intestinale : une biodiversité essentielle peu connue.

Dans le cadre de sa série de webinaires en 2021, l’association Biodiversity For Peace propose une suite d’articles permettant de continuer d’informer et de sensibiliser à des sujets en lien avec l’environnement et/ou le bien-être. Jusqu’à la prochaine saison des webinaires, un article paraîtra par semaine.

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Source : Laurent Berta – Santé et Nutrition

Qu’est-ce que le microbiote ?

En terme général, un microbiote est l’ensemble des micro-organismes, bactéries, virus, parasites, champignons non pathogènes (qui ne nous rendent pas malades) qui vivent dans un environnement spécifique. Dans notre corps nous avons 100 fois plus de bactéries étrangères que nous avons de cellules qui sont les nôtres : nous sommes des supra-organismes (un ensemble composé par un organisme animal ou végétal et les micro-organismes qu’il héberge). Nous en trouvons à différents endroits : le ventre, les poumons, la peau, le vagin. Aujourd’hui quand est abordé le sujet du microbiote, c’est souvent le microbiote intestinal qui est sous-entendu, car il représente 80% de notre microbiote.

Le microbiote intestinal correspond aux micro-organismes qui vivent dans notre côlon et notre intestin grêle. On en entend parler souvent sous un autre nom : la flore intestinale. Ce nom est intéressant, car le microbiote est comme une petite forêt composée d’une grande biodiversité déposée sur les parois de nos intestins. Et de la même façon qu’il faut protéger la biodiversité des forêts sur terre, la biodiversité de notre microbiote doit être préservée pour rester en bonne santé.

Microbiote et santé, un effet indiscutable

Les avancées de la science ont permis d’établir des liens entre l’état du microbiote et la modification de notre état de santé, en voilà plusieurs exemples :

  • Notre microbiote intestinal joue un rôle crucial dans les fonctions digestives, les micro-organismes se nourrissent de ce que nous mangeons, ce sont eux qui font le tri entre les « bons » et les « mauvais » nutriments que nous ingérons. Plus nous mâchons et avalons doucement, plus ces organismes auront le temps de travailler correctement, évitant ainsi les ballonnements et autres difficultés de digestion.
  • Le microbiote aide notre système immunitaire en faisant rempart contre les mauvaises bactéries. La qualité des micro-organismes accrochés sur notre paroi intestinale dépend, on l’a vu, de la qualité de notre alimentation. Un mauvaise alimentation peut entrainer la disparition des micro-organismes « bénéfiques », laissant la place aux bactéries pathogènes, entrainant la dégradation de notre état de santé.
  • Dans cette même logique, ces bactéries protègent notre état physiologique et nos comportements, un microbiote en mauvais état peut nous rendre irrité, voire favoriser des états dépressifs.

De la même façon, un lien a été trouvé entre un microbiote peu diversifié et de nombreuses maladies : obésité, cancer, diabète, allergies… certaines encore incurables en 2021. Nous pouvons atténuer les effets, mais pas guérir les patients. C’est le cas de la maladie de Crohn, une maladie inflammatoire chronique de notre système digestif, dans son cas il n’existe aucun traitement et le microbiote pourrait être une réponse.

Alors, qu’est-ce qui modifie la composition et la diversité de cet écosystème essentiel ? Et, comment améliorer notre microbiote pour éviter ces maladies et améliorer sa santé ?

Création et destruction du microbiote

Le microbiote se forme dès la naissance. Lors de l’accouchement, le bébé est mis au contact des bactéries du microbiote vaginal de la mère qui seront les premières à coloniser le tube digestif. La multiplication des accouchements par césarienne entraine la dégradation de l’état de base du microbiote des nouveaux nés, pour cette raison, des tentatives de mise au contact post natal avec le microbiote de la mère ont été effectuées et les résultats ont montré des bébés en meilleure santé. Le microbiote est ensuite complété par l’alimentation et l’hygiène de l’individu, les médicaments et l’environnement dans lequel celui-ci grandit. Le microbiote atteint son stade de maturité lorsque l’individu atteint trois ans, mais il continue d’évoluer tout au long de la vie.

Tous ces facteurs expliquent pourquoi notre microbiote est unique, tout simplement parce qu’il est le reflet de nos interactions avec l’extérieur depuis le début de notre vie.  Raison pour laquelle nos choix de modes de vie et les environnements au sein desquels nous évoluons, entraînent de fortes variations de l’état du microbiote.

Les déséquilibres alimentaires sont un des danger majeur pour notre microbiote :

  • Malnutrition : Dans les sociétés modernes les populations sont sujettes à une alimentation peu diversifiée, souvent riche en gras, sucre et en protéines avec beaucoup moins de fibres.
  • Sous-nutrition : Comme la malnutrition, le manque d’apport en fibres et l’absence de diversité entrainent un mauvais développement du microbiote et par conséquent, un système immunitaire moins résistant.
  • Surnutrition : elle pose un autre problème, si nous mangeons trop, le microbiote aura du mal à travailler correctement et les mauvaises bactéries trouveront plus facilement leurs places.
  • Environnement et habitudes : Dans les sociétés modernes, nous sommes beaucoup plus mobiles. Si un individu déménage en Inde, il faudra du temps à son microbiote pour s’adapter à la nourriture épicée, entrainant des dégradations pendant un temps de l’état de santé.

Dans la médecine moderne, les antibiotiques ont pris une grande importance, comme leur nom l’indique, ils sont « anti » « biotique » et donc, ils détruisent toutes formes de vie (biotique > bio = la vie). Bien qu’ils soient très efficaces pour guérir la maladie pour laquelle ils ont été pensés, les antibiotiques ne peuvent pas faire la différence entre les bactéries aidantes et celles qui nous attaquent. Il ne faut pas en abuser, car une prise peut détruire tout notre microbiote.

Quand notre microbiote va mal on dit qu’il y a dysbiose, les signes sont : des ballonnements dans l’intestin, des gaz nauséabonds, des selles défaites, une haleine putride et/ou des crampes abdominales. Nous pouvons citer un exemple de maladie du microbiote tel que le SIBO, il réunit tous les symptômes d’une dysbiose de façon extrême, il ne faut pas hésiter à en parler à son médecin si ces signes sont constatés.

Comment avoir un microbiote en bonne santé ?

Les médecins recommandent de manger varié et privilégier les aliments riches en fibres : légumes, légumineuses et fruits. Il faudrait aussi éviter les pesticides en mangeant des produits issus de l’agriculture biologique. Aussi il faudrait limiter sa consommation de viande et de sucre ainsi que manger en petite quantité et lentement. Enfin, les antibiotiques doivent être pris sur avis médical et seulement si c’est nécessaire. Nous n’oublions pas cette fameuse campagne de prévention française « les antibiotiques, c’est pas automatique ».

Il existe également un certain nombre d’aliments qui réparent et améliorent le microbiote et qui sont donc excellents pour notre santé en général :

Topinambour, Panais, Salsifis, Navets, Asperges, Chicorée, Artichaut, Banane, Baies, Myrtille, Cerise, Fraise, Curcuma, Sardine, Poisson Gras etc…

Les recherches en cours

La recherche la plus avancée concerne la transplantation fécale. Il s’agit de transplanter par le nez la matière fécale d’une personne saine. Pour l’instant elle a seulement été testée dans le cadre de la maladie de Crohn et les résultats sont très prometteurs. Des progrès ont été faits également sur les liens entre état du microbiote et obésité : des tests ont été réalisés sur des souris (qui ont un microbiote proche du nôtre). On a transféré des cellules d’un microbiote obèse sur des souris saines et elles sont tombées malades. Le même phénomène fut observé pour des microbiotes anorexiques. Ces expériences sont en train de prouver également l’aspect génétique de ces maladies, car une maman au microbiote déséquilibré pourrait le transmettre à son enfant.

Plusieurs autres pans de la médecine s’intéressent au microbiote : des travaux en 2017 ont montré que le système cardio-vasculaire était attaqué par les mauvaises bactéries, donc était sensible à un microbiote en mauvais état. La science tente de prouver le lien avec la maladie d’Alzheimer, mais également avec des maladies chroniques comme les allergies. En améliorant le microbiote, on pourrait supprimer leurs aspects chroniques. Enfin, chez les patients atteints d’autisme, il a été découvert que leurs douleurs provoquant des crises étaient souvent liées à des dysbioses. En soignant leur microbiote, nous pouvons améliorer largement leur qualité de vie. r

Conclusion : Les principales idées à retenir ?

  1. Le microbiote intestinal correspond à l’ensemble des micro-organismes dans notre tube digestif.
  2. Un microbiote diversifié est équivalent à un corps et un esprit sains.
  3. Pour entretenir un microbiote varié, nous devons avoir une alimentation variée, biologique et riche en fibres (légumes).
  4. Ne prenons des antibiotiques que lorsqu’ils sont prescrits par le médecin et nécessaires.
  5. Avec les découvertes récentes sur le microbiote, nous pensons que certaines maladies aujourd’hui incurables pourraient être guéries (Crohn, obésité, autisme, Alzheimer).

Sources 

Microbiote, les fabuleux pouvoirs du ventre – ARTE – 2019 – Youtube [en ligne]

Le microbiote intestinal au service de notre santé – Université de Liège  – 2017 –  Youtube [en ligne]. URL : https://www.youtube.com/watch?v=uzdvI2GPVPc

Microbiote: un écosystème fragile à préserver – Sylvie Logean – 2019 – Le temps [journal en ligne] URL :  https://www.letemps.ch/sciences/microbiote-un-ecosysteme-fragile-preserver
Pourquoi le microbiote pourrait changer l’avenir de la médecine | Interview | ARTE – 2020 Youtube [en ligne] URL :  https://www.youtube.com/watch?v=i-JIWuYqkfw&t=558s

Le microbiote intestinal, pourquoi est-il essentiel ? 2021 – Curien [En ligne] URL : https://www.curieux.live/2020/04/28/le-microbiote-intestinal-pourquoi-est-il-essentiel/

Le régime microbiote André Burckel – 2016 – Broché

L’influence du microbiote intestinal sur le psychisme –  Delphine Bonnaud –2020 – ’Association Professionnelle de Psychologie Biodynamique [en ligne]  URL : https://appb.org/linfluence-du-microbiote-intestinal-sur-le-psychisme/

Microbiot des plantes – Wikipedia – 2021 [En ligne] URL : 

https://fr.wikipedia.org/wiki/Microbiote_des_plantes

Bactéries, champignons, micro-organismes, pathogènes – Arbre Patrimoine -2021 [En Ligne] URL :https://www.arbre-patrimoine.fr/bacteries-champignons-micro-organismes-pathogenes/  
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